附睾管的管腔整齐，上皮较厚属假复层柱纤毛上皮，纤毛长但不运动，又称静止纤毛。附睾上皮由两类细胞组成，一类叫主细胞，一类叫基细胞。
1．主细胞
这类细胞数目较多，呈高柱状。在附睾头部，其高度为120um，宽度不超过10um，体部高度为80um，至尾部则降为50um，这个高度包括静止纤毛，它占整个高度的1／3．静止纤毛的高度不一，有的区域没有．上皮顶部有连接复合体，但无缝隙连接。核位于细胞下半部，长形或卵圆形，细胞质在电镜下可分为几个区：
核下区：RER丰富，近核处呈同心圆排列。在有的细胞基部有许多线粒体，与细胞的吸收有关’和在肾近侧曲管和唾液腺分泌管细胞内所观察到的相似。这种形态结构主要见于头部。
核周区：此区很窄，含有RER的纵行池。
核上区：这一区的主要特点是含有大的高尔基体，由囊泡与小泡组成。大部分高尔基体位于核附近，有的则位于细胞顶部。顶部细胞质含有明亮的小泡，大多数与高尔基体相连。
主细胞内线粒体丰富，其横嵴分散在整个细胞质内，但在细胞两端更为丰富。
主细胞的包含物为大泡与小泡，泡内含均质状，颗粒状或板层状嗜锇物质，它们是类脂或脂褐素。此外，多泡体很明显，特别在附睾头部。多泡体是溶酶体的一种型式’与吸收功能有关。多泡体进一步发育形成类脂小泡或含髓鞘状内含物。
主细胞内还含有许多微管，在核上区与细胞长轴平行排列。
2．基细胞
细胞呈锥体形，其高度约为25um，位于主细胞基部之间。基细胞的表面与相邻主细胞之间形成广泛的嵌合连接。核卵圆形，染色质呈细颗粒状，核内有时可见大的内含物。细胞质内细胞器很少，有RER，高尔基体，线粒体与少量空泡。细胞质内还有许多微丝束，这些微丝束不互相交叉，与细胞膜也不发生连系。
人的附睾上皮主要由这两种细胞组成，在其他哺乳类动物，例如大鼠，附睾上皮除了主细胞和基细胞以外，尚含有下列几种细胞，
3．顶细胞
这种细胞的核位于顶部，表面仅有少量微绒毛，细胞狭长，顶部稍宽。这种细胞也存在于其他器官内，被认为能分泌酸性分泌物和自管腔吸收水分。这种细胞多位于附睾头部，它们与主细胞的比例为1：5。
4．狭窄细胞
很狭，用甲苯胺蓝染色较主细胞为深，核位于顶部。顶部细胞质空泡较多，腔面微绒毛较主细胞为少且短。狭窄细胞数目较少，与主细胞的比例为1：29。
5.亮细胞
此种细胞多见于尾部。细胞矮柱或立方状。在HE染色的切片中，胞质中有许多空泡。有谓亮细胞来自狭窄细胞，因两者超微结构相似，两者均有炭酸酐酶。从发生的角度来看，大鼠生后16天，狭窄细胞见于附睾各段，35天左右狭窄细胞消失而代之以亮细胞。
6.晕细胞
为游走进入上皮的淋巴细胞，位于主细胞之间，因为细胞周围有一空隙的晕，故称晕细胞。过去认为人的附睾上皮内不存在这种晕细胞，最近王一飞与Holstein观察了12例人的附睾，年龄自23—81岁，发现在人的附睾也存在这种晕细胞，其形态与大鼠附睾中所见相似，老年人附睾上皮中的淋巴细胞多于青年人。他们并发现人附睾上皮内尚可见到巨噬细胞，也是老年人较多。有时可看到上皮内的淋巴细胞和巨噬细胞在一起，两者之间仅有极狭的间隙，无细胞连接。淋巴细胞内的内质网与线粒体多集中在靠近巨噬细胞的一侧，似乎可以说明两个细胞之间有某种功能上的联系。已知巨噬细胞能捕捉抗原’加以处理后传递给淋巴细胞。上述形态学现象似可证实这一点。附睾上皮内的淋巴细胞可能构成一种局部免疫屏障，阻止精于抗原与血循环接触。所以在青春期以前，附睾上皮内没有淋巴细胞，而到了老年，附睾内精于变性增多，附睾上皮内的淋巴细胞也增多。
在附睾的固有膜内有游离的淋巴细胞与巨噬细胞，其形态与附睾上皮内所见相似，故附睾上皮内的这两种细胞很可能来自固有膜。
