造成精液异常的疾病和因素很多，也极其复杂。某一项精液指标的异常，可由一种或一种以上的疾病或因素引起，而同一种疾病或因素又可导致多项精液指标的改变。所以，了解导致精液异常的常见病因及分类对治疗不育症是非常重要的。
(1)泌尿生殖系统感染所致的精液异常：如淋病、生殖道结核、腮腺炎合并睾丸炎以及各类细菌、病毒、支原体、寄生虫等泌尿系感染，均可影响精液质量或阻塞输精管道而导致精液异常。
(2)内分泌功能紊乱所致的精液异常：如克氏综合征所致睾丸萎缩、放射线或细胞毒素等引起的睾丸损害，以及脑肿瘤、炎症、手术损伤、化疗、放疗等导致睾丸内分泌功能低下；垂体肿瘤等导致下丘脑——垂体——睾丸轴的功能降低；甲状腺机能减退、甲亢、先天性肾上腺增生症等许多导致内分泌功能紊乱的疾病均可导致生精功能障碍，出现精液异常如少精子症、无精子症等。
(3)精索静脉曲张所致的精液异常。
(4)先天性异常或遗传性疾病所致的精液异常：如无睾症、隐睾、异位睾丸、睾丸发育不良以及先天性附睾、输精管、精囊发育不全或缺如；前列腺发育不良、憩室等；遗传性疾病见于真两性畸形、克氏综合征、唯支持细胞综合征、男性Turner's综合征、XYY综合征和多XY综合征等。
(5)其他因素所致的精液异常：主要有电离辐射如X射线、γ射线等物理因素；有机杀虫剂(如D D T、六六六、敌敌畏、对硫磷等)、食物添加剂(亚硝基化合物)及除锈剂、杀真菌剂、杀螨剂和薰剂等，某些金属元素如镉、铝、砷、汞等化学因素；药物因素如氯丙嗪、丙咪嗪、阿米替林、阿斯匹林、消炎痛、环磷酰胺、苯丁酸氮芥、长春新碱、甲基多巴、呱乙啶等；长期使用烟、酒、茶、咖啡及毒品等嗜好品及不良生活习惯如偏食、热气蒸浴过频过久、内裤穿着太紧和情绪过于忧郁等均可造成精液异常。
